A necessidade da diminuição de emissão de poluentes traz à tona projetos de aeronaves mais flexíveis. A identificação de modelos que representem essas aeronaves é importante para comparação com modelos previamente desenvolvidos nas fases de projeto. O presente trabalho tem como objetivo a identificação paramétrica no domínio do tempo de aeronaves com diferentes níveis de flexibilidade. A identificação é realizada num modelo de estabilidade e controle longitudinal reduzido para a dinâmica de período curto, a partir da metodologia Quad-M (Manobra, Medidas, Modelo e Método). O método de identificação empregado é o método do erro na saída, e são avaliadas duas aeronaves: um aeromodelo considerando somente corpo rígido, e a uma aeronave flexível modelo com 3 configurações de flexibilidade diferentes. As medidas são obtidas através de simulação não-linear de ambas as aeronaves. Comparações entre as identificações de cada configuração flexível da aeronave modelo comprovam a melhoria dos valores paramétricos obtidos com a adição dos efeitos elásticos nos modelos de identificação. São analisadas hipóteses sobre os sensores possíveis de serem utilizados, a fim de realizar procedimentos mais próximos de serem repetidos em um ensaio em voo. Compara-se as identificações considerando medidas de deflexão e acelerômetros como variáveis de observação, e as medidas de aceleração resultam em parâmetros mais próximos do ideal. Futuramente, as análises presentes nesse trabalho podem ser utilizadas para a identificação com ensaios em voo das aeronaves flexíveis não-tripuladas.